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深圳市中小企业服务局属于深圳市工业和信息化局管理的副局级行政机构,两个部门(深圳市工业和信息化局和深圳市中小企业服务局)都可以进行认定。根据《政府采购促进中小企业发展管理办法》也可以由企业注册地区工信部门认定。